УФНС России разъяснило действия налогоплательщика, если уплаченная сумма не отразилась на Едином налоговом счете.
Убедиться в корректности платежного документа:
Проверить ИНН, реквизиты получателя, КБК, сумму.
Убедиться в факте исполнения платежного поручения.
Проверить состояние ЕНС в личном кабинете налогоплательщика:
При необходимости можно заказать справку о сальдо ЕНС.
Также закажите справку о принадлежности сумм, перечисленных в качестве единого налогового платежа (ЕНП).
Если платежа нет в составе операций по ЕНС, можно поступить так:
Воспользоваться сервисом ФНС России «Оперативная помощь: разблокировка счета и вопросы по ЕНС»:
Здесь плательщики могут сообщить налоговым органам о несогласии с имеющимся сальдо ЕНС и о необходимости актуализировать его.
Обращение будет рассмотрено в течение 24 часов в рабочие дни. 
Обратиться в налоговый орган через личный кабинет налогоплательщика:
Перейдите в подпункт меню «Детали».
Затем перейдите по активной ссылке «Нашли ошибку в данных? Сообщите нам».
Заполните открывшуюся форму.
При необходимости к обращению можно приложить платежное поручение, подтверждающее оплату.